Kabak çekirdeği, besin değeri oldukça yüksek olan ve birçok kişinin severek tükettiği bir kuru yemiştir. Kabak çekirdeğinin 100 gramında, günlük ihtiyacımızın %27'si kalori, %16'sı lif, %49'u protein, 181 mg omega-3 yağ asidi, 20.703 mg omega-6 yağ asidi, %151 manganez, %134 magnezyum, %83 demir, %69 bakır, %64 K vitamini, %50 çinko, %11 fosfor ve %23 potasyum bulunur. Kabak çekirdeği, birçok mineral, vitamin ve lif açısından oldukça zengin bir besindir. Küçük olmasına rağmen, sağlığa olan faydaları oldukça fazladır.

Kabak çekirdeği, sağlığa zararlı olmayan doymamış yağlar içerir ve bitkisel omega-3 kaynağıdır. Bu bakımdan iyi bir besin ve enerji kaynağı olmakla birlikte, bağışıklık sistemini de güçlendirir. Protein bakımından da oldukça zengindir. Stresin ve depresyonun azaltılmasında faydalı olabileceği gibi, uyumadan önce yenildiğinde iyi bir uykuya yardımcı olabilir. Antioksidan yönünden zengin olduğu için kalp-damar sağlığı açısından faydalı olduğu söylenebilir. Şeker hastaları ve diyabeti olanlar için birçok gıda sakıncalı görülürken, kabak çekirdeği kan şekerinin dengelenmesine yardımcı olabilir.

Bir avuç kabak çekirdeği yenildiğinde, lif oranı yüksek olduğu için tokluk hissi uyandırır ve spor sonrasında yağ yakılmasında etkili olabilir. Demir, çinko ve magnezyum içermesi bakımından cilt, saç ve tırnak sağlığı için de iyi gelebilir. Ancak, birçok gıda türünde olduğu gibi bayat kabak çekirdeği mide bulantısına sebep olabilir ve bu nedenle taze tüketilmelidir. Fazla yenildiğinde rahatsızlık verebilir ve kilo alımına sebep olabilir.

Kabak çekirdeği, içerdiği yüksek antioksidanlar sayesinde serbest radikallerle savaşır ve yaşlanma belirtilerini geciktirebilir. Ayrıca, içerdiği çinko sayesinde bağışıklık sistemini destekler ve enfeksiyonlara karşı koruma sağlar. Kabak çekirdeği, aynı zamanda prostat sağlığına da faydalıdır ve prostat büyümesini engelleyebilir. Lif içeriği sayesinde sindirim sistemini düzenler ve kabızlık gibi sindirim sorunlarının önüne geçer.